Bioinformatics

wig、bigWig和bedgraph文件详解

我们一般会熟悉sam/bam格式文件,就是把测序reads比对到参考基因组后的文件!bam或者bed格式的文件主要是为了追踪我们的reads到底比对到了参加基因组的什么区域,而UCSC规定的这几个文件...
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Statistics

用RevMan做meta分析

我们知道Review Manager,也就是常说的RevMan,是meta分析最经典的软件。RevMan主要对二分类变量和连续变量进行meta分析,合并两组的OR 、RR、RD以及两组的均数差和标准化...
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Single Cell

单细胞分析之xCell

xCell简介 xCell是开发SingleR包的团队2017年推出的一款推断bulkRNA样本中细胞类型比例的R包,目前在google学术查到它有598次引用。xCell的工作原理是用机器学习算法提...
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Statistics

SPSS:趋势卡方检验

毕业季接近尾声,通过答辩的各位同学们即将开始新的旅程。回顾论文点滴,想必既有心酸又充满欣慰。回顾毕业生咨询论文写作得到一个启示与各位分享:论文完成的过程也是还原临床研究的过程,论文收集资料后进行统计分...
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Statistics

统计基本概念

本文讲述了数据分析师应当了解的五个统计基本概念:统计特征、概率分布、降维、过采样/欠采样、贝叶斯统计方法。 从高的角度来看,统计学是一种利用数学理论来进行数据分析的技术。象柱状图这种基本的可视化形式,...
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