Inparanoid是一个寻找物种间直系同源基因的软件，同时相应的网站目前包含了100 organisms， 1687023 sequences。 Inparanoid单机版程序是一款非常优秀的寻找直...

PGAP（Pan-Genomes Analysis Pipeline） 是一款用于原核生物泛基因组学分析的自动化软件。它主要包括以下五大功能： 功能基因的聚类：根据序列相似性，将所有细菌中的功能基因按...

RNA-PET是一种用第二代测序平台（Illumina GA和SOLiD）分析全长转录本的双末端标签（PET）测序的方法。和传统的随机剪断序列成短片段的RNA-Seq方法不同，RNA-PET捕获并测序...

GenomicTools是一个灵活的计算平台，主要用来分析和处理高通量测序数据，比如RNA-Seq 和 ChIP-Seq。GenomicTools可以完成在基因组区域集中各种数学运算，因此可以设计一个...

GenePattern是一个强大的基因组学分析平台，该平台整合了大量的基因表达分析、蛋白质组学分析、SNP分析、流式细胞分析、RNA-seq数据分析以及一些常规的生物信息学分析工具。 以下是官方介绍：...

RNA-SeQC是一个计算一系列对RNA-Seq数据进行质量控制的计量学的java程序。输入内容可以是一个或者多个BAM文件。输出文件是则包括计量数据的HTML报告和tab delimited文件。这...

  (1)  DNA模板问题（关键因素） (a) 非特异PCR产物     现象：每个峰下面都有其他颜色。 原因：PCR主带与杂带混在一起测序。 对策：凝胶电泳回收主带，重新测序。 (b) 非单克隆 ...

 Cap3简介 Huang, X. 和 Madan, A 开发的一套用于序列拼接的软件,此软件适用于小的数据集或 EST 拼接,它有如下特征： 利用正反向进行拼接，更正拼接错误、连接 contigs。...

Bootstrap又称自展法，是用小样本估计总体值的一种非参数方法，在进化和生态学研究中应用十分广泛。例如进化树分化节点的自展支持率等。 Bootstrap的思想，是生成一系列bootstrap伪样本...

你对Perl语言中Perl文件操作的方法是否比较明确，这里向大家简单介绍几种Perl文件操作的技巧，希望本文的介绍能让你有所收获。 本文和大家重点学习一下几种Perl文件操作技巧，主要从七个方面来向大...