武汉大众源生生物信息学培训班

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  • 我们培训内容包括基础的计算机基础知识,同时包含生物信息分析的热点领域。
  • 从计算机基础知识和信息分析两方面,带您一步一步走进生物信息。
  • 上机实践一直伴随着整个课程,案例式的计算机基础知识学习方式,让您无需计算机基础也能轻松理解,掌握生物信息分析的前因后果!
  • 培训费用只要1200元。
  • 我们的讲师都有三年以上信息分析经验,参与过重大科研项目,曾在Nature、Nature Genetics、Nature Biotechnology、Genome Research等国际期刊上发表过文章。

课表如下,想了解更多信息请参见: http://www.pubbiotech.com/training_aug_2013/

报名方式:

1. 电话报名:027-8729 7418
      2. 网上报名:请到一下网址了解更多信息并填写报名表单:
http://www.pubbiotech.com/training_aug_2013

3. 邮箱报名:请将您的姓名、单位(院校)、联系方式等发送到 support@pubbiotech.com

时间安排
课程内容
第一天 第一天上午 一、NGS的基础知识
1. NGS的应用领域
2. 测序原理及文件格式
3. 不同应用领域实验方法的差异
第一天下午 二、Linux基本操作
1. 理解linux的基础特征,与windows系统的区别;Linux安装
2. 能进行目录切换,文本文件查看/编辑,文件复制、删除等操作
3. 用户及权限管理
4. man、vi、grep、awk、sed、wc、scp、gzip、tar等基础命令
三、perl编程
1. perl语言中的标量、数组及表达式
2. 条件、循环等基本操作及嵌套和哈希表
3. 文本文件读写的操作
4. 字符串的操作
5. 正则表达式
第二天 第二天上午 复习Perl编程
四、基因组Denovo之组装
1. 数据过滤
2. Kmer分析
3. 组装原理
第二天下午 五、基因组Denovo之注释
1. 重复序列注释
2. 基因结构注释
3. 基因功能注释
4. ncRNA注释
第三天 第三天上午 六、基因组Denovo之进化
1. 基因家族鉴定
2. 物种树构建及分化时间估算
3. 全基因组复制事件
4. 共线性分析
第三天下午 七、表观基因组
1. BS数据分析流程
2. 免疫共沉淀与测序技术结合分析表观
第四天 第四天上午 八、全基因组重测序
1、SNP、Indel等变异检测;
2、群体进化相关的分析内容
第四天下午 九、小RNA
1. 不同类型的小RNA鉴定
2. novel miRNA鉴定
3. 靶基因预测
4. GO功能富集分析
第五天 第五天上午 十、转录组-denovo
1. 转录组组装
2. 表达定量分析
3. 差异表达分析
第五天下午 十一、转录组-ReSeq
1. 可变剪切的鉴定
2. 优化基因结构
3. 预测新转录本

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