生物学家和遗传学家长期以来想要在单个细胞水平上分析基因表达谱，但是技术限制一直使得它不能成为现实。 根据2012年7月22日在线发表在Nature Biotechnology期刊上的一项研究，研究人员...
新基因组测序方法能够在单细胞水平上分析基因表达谱
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千年基因率先推出454+（GS FLX+）转录组测序
自罗氏旗下454生命科学推出测序读长达1,000 bp的454+（GS FLX+）测序系统以来，千年基因已利用该平台成功开展了大量全基因组测序项目。其中，苣苔的全基因组de novo测序组装已经初步完...
How do sequencing errors affect de Bruijn graphs?
Today’s commentary is the fourth in our de Bruijn graph series, but I did not like Roman characters ...
ABI测序仪
过去20年，美国应用生物系统公司（ABI）在测序方面一直占据着垄断地位。自公司的共同创始人Leroy Hood在上世纪80年代中期设计了第一台自动荧光测序仪之后，生命科学研究就摆脱了手工测序的繁琐和辛...
ROCH-454 测序仪介绍
454公司可谓新一代测序技术的奠基人。2005年底，454公司推出了革命性的基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统——Genome Sequencer 20 System，被《Nature》杂志以里...
Illumina 测序仪介绍
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发，利用其专利核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结（reversible terminator）”，实现自动化...
Strand Specific mRNA sequencing 之重要性与分析
研究生物基因转录体的方法有许多种，而使用次代定序仪系统进行转录体定序是目前相当热门的一种方式，科学家们使用 RNA-seq 分析转录体表现主要期望能够获得三种重要信息： 1. 了解整个转录体构造、sp...
二代测序数据预处理与分析
Next generation sequencing (NGS) 常使用的工具列表 质量控制Quality Control：FastQC、Fastx-toolkit 拼接Aligner：BWA，Bow...
常用的SNP检测方法
SNP 是指基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA 序列多态性，在群体中的发生频率不小于1 %。包括单个碱基的转换、颠换、插入和缺失等。所谓转换是指同型碱基之间的转换，如嘌呤与嘌呤( G2A) ...
第二代测序数据处理工具软件汇总
Integrated solutions * CLCbio Genomics Workbench – de novo and reference assembly of Sanger, Roche F...