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首页scaffold
Genomics

Pacific Bio用于基因组组装

We are really amateurs, when it comes to Pacific Bio sequences. How amateur are we? A few weeks back...
06月24日2,132评论基因组组装 序列
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Glossary

基因组拼接中常见的名词解释

Read:高通量测序平台产生的序列就称为reads。 Contig:拼接软件基于reads之间的overlap区,拼接获得的序列称为Contig(重叠群)。 Scaffold:基因组de novo测序...
06月10日10,0395NGS 测序
阅读全文
Genomics

Newbler output II: contigs and scaffolds sequence files, and the 454Scaffolds.txt file

The files most people are after when they do an assembly must be these: the actual contig and scaffo...
03月30日1,466评论454 拼接
阅读全文
Glossary

What is scaffold?

A scaffold is a portion of the genome sequence reconstructed from end-sequenced whole-genome shotgun...
12月18日2,0481 scaffold
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Genomics

SSPACE:一款专门做scaffolding的软件

在做基因组拼接的时候,有时候已经获得了一堆contig或者scaffold,然后需要利用另外的一个pair-end或者mate-pair文库进一步做scaffolding的话。用什么软件好呢? 最近使...
10月30日6,84412assembly genome
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