hmmer的安装与使用 Genomics

hmmer的安装与使用

从功能基因研究的角度来讲,相关的搜索,比如从序列数据库中,找同源的序列,或者对一个对一个新的基因功能进行鉴定,使用hmmer比使用blast有着更高的灵敏度已经更高的搜索速度,但其应用还远没有blas...
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基于HMM的基因功能鉴定 Glossary

基于HMM的基因功能鉴定

  目的: 鉴定该物种中某个基因家族的所有成员; 每个基因的功能鉴定; 什么是HMM:         HMM(Hidden Markov Model,隐马尔科夫模型)是一种用参数表示的用于...
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蛋白注释相关的工具 Bioinformatics

蛋白注释相关的工具

随着蛋白质数量的增加,对于这些蛋白质的分类与注释成为一个非常活跃的课题。这里将包含所有蛋白质序列的集合称为nr库,在nr库中,序列与序列的相似性是不均等的,当我们使用blast进行序列两两比对的时候,...
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