TranscriptomicsRNA-Seq数据分析新方法流程(HISAT、StringTie和Ballgown) Tophat+cufflinks组合是RNA-Seq数据分析的一个很经典的分析方法了,四年前关于这两个软件的使用,Nature Protocol专门发文介绍如何使用这两个软件,具体可以参考《利用top... 08月31日16,9831 RNA-seq 转录组 阅读全文
TranscriptomicsRNA-seq比对软件HISAT说明书 取代bowtie tophat进行RNA-seq比对 HISAT全称为Hierarchical Indexing for Spliced Alignment of Transcripts,由约翰霍普金... 01月14日5,228评论HISAT RNA-seq 阅读全文
TranscriptomicsRNA-Seq分析新工具 利用RNA-Seq技术来分析转录组现在是一种很普遍的方法,在我读PhD期间分析过细菌的转录组数据。做差异表达分析的基本流程是:做质量控制->利用bwa map reads到基因组上->计算... 03月20日20,2466RNA-seq 转录组 阅读全文