Transcriptomics

差异表达分析之FDR

本文来自百迈客基因微信公众号(BMK_product) 随着测序成本的不断降低,转录组测序分析已逐渐成为一种很常用的分析手段。但对于转录组分析当中的一些概念,很多人还不是很清楚。今天,小编就来谈谈在转...
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Statistics

浅谈多重检验校正FDR

例如,在我们对鉴定到的差异蛋白做GO功能注释后,通常会计算一个p值。当某个蛋白的p值小于0.05(5%)时,我们通常认为这个蛋白在两个样本中的表达是有差异的。但是仍旧有5%的概率,这个蛋白并不是差异蛋...
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Bioinformatics

多重假设检验中的p值校正

在生物学特别是基因组学的研究工作中,经常会遇到多重假设检验(multiple testing)的问题;此时,得到的原始p值需要进行校正后才能使用,那么哪种校正方法更加适合自己的研究工作呢?p-valu...
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Transcriptomics

差异基因分析方法

在利用RNA-seq数据比较分析两个样品中同一个基因是否存在差异表达的时候,一般选取两个标准: i)FoldChange FoldChange,很容易理解了。就是两样品中同一个基因表达水平的变化倍数。...
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