TranscriptomicsDESeq2差异基因分析和批次效应移除 基因表达标准化 不同样品的测序量会有差异,最简单的标准化方式是计算 counts per million (CPM),即原始reads count除以总reads数乘以1,000,000。 这种计算方... 11月03日 8,186 评论 阅读全文
Transcriptomics用DESeq2包来对RNA-seq数据进行差异分析 差异分析的套路都是差不多的,大部分设计思想都是继承limma这个包,DESeq2也不例外。 DESeq2是DESeq包的更新版本,看样子应该不会有DESeq3了,哈哈,它的设计思想就是针对count类... 04月15日 23,242 3 阅读全文