Bioperl的简单安装 Script

Bioperl的简单安装

按照Bioperl上介绍的方法在linux下安装Bioperl老是安不上,或者是安装上了,但不能用,上面介绍的几种方法都试了,全不行,后面自己想了个办法,就是利用cpan只对要用到的模块进行单独安装,...
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快速计算fasta序列长度的方法 Bioinformatics

快速计算fasta序列长度的方法

最近看了一下进入PLoB的网页来路分析,看到有同学搜索计算fasta序列长度。其实自己在之前的数据分析中也遇到过相关的问题,这里给大家分享两种我常用的方法。 方法一:linux下用awk计算fasta...
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Bioperl快速检索序列(Bioperl HOWTO翻译11) Script

Bioperl快速检索序列(Bioperl HOWTO翻译11)

索引序列文件以用于快速检索 英文原文 索引序列是Bioperl一个非常出色的功能。你可以将需要处理的本地序列文件建立一个索引然后利用这个索引提取你所需要的序列文件。这样做最重要的原因是——速度!从有索...
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详解Bioperl的序列对象(Bioperl HOWTO翻译7) Script

详解Bioperl的序列对象(Bioperl HOWTO翻译7)

序列对象 英文原文 前面涉及到了很多序列对象,展示了序列对象的一些创建和使用方法。这里来详细描述序列对象的功能。 下表列出了序列对象的‘方法’(面向对象编程中的概念,见前文;表的内容就不翻译了)。‘r...
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