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Bioinformatics

Blastall常用参数简析

         BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)  基本局部比对搜索工具,是一套在蛋白质数据库或 DNA 数据库中进 行相似性比较的分析工具,它是基...
12月02日6,681评论alignment BLAST
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Glossary

序列以及序列比对中常见术语

有些你看着知道,其实让你说,又说不出多少;有些你以为自己知道,但你不知道自己仅仅了解了其中的一部分。许多概念,虽说只是一个词,但是其背后是一个专业的领域模型,每一个概念在不同的环境有着不同的故事,看见...
12月02日3,393评论alignment sequence
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TranslatorX server:基于氨基酸序列的核酸比对工具

通常进行多序列比对的时候都是多条蛋白序列或者多条核酸序列进行比对。而TranslatorX是利用蛋白比对的结果对核酸序列进行比对的工具。 TranslatorX分为两个版本,其一是在线服务器,另外提供...
11月25日3,742评论alignment sequence
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得分矩阵PAM与BLOSUM的比较与区别

对于蛋白质序列,计分矩阵主要用于记录在做序列比对时两个相对应的残基的相似度,一旦这个矩阵定义好了以后,比对程式就可以利用这个矩阵,尽量将相似的残基排在一起,以达到最好的比对。 得分矩阵主要有两种,第一...
09月21日6,326评论alignment PAM
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