首先这两款软件都是用于基于参考基因组的转录组组装，当然也可用于转录本的定量。前者于2016年的 protocol上发表的转录组流程HISAT, StringTie and Ballgown后被广泛使用...

我最早接触转录本的定量则是Alignment-based transcript quantification，也就是先比对后定量。我最先是在无参转录组中用了RSEM，因为无参转录组需要对reads进行...