用snpEFF对vcf格式的突变数据进行注释 Genomics

用snpEFF对vcf格式的突变数据进行注释

这个软件比较重要,尤其是对做遗传变异相关研究的,很多人做完了snp-calling后喜欢用ANNOVAR来进行注释,但是那个注释还是相对比较简单,只能得到该突变位点在基因的哪个区域,那个基因这样的信息...
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二代测序的Barcode选择 Bioinformatics

二代测序的Barcode选择

1 混合样本测序 现代测序仪的生产能力正在经历突飞猛进的提高,数据量远远大于单个样本测序所需,因此在很多情况下,需要把多个样本混合在一起测序,以充分发挥仪器的能力,节约测序成本。像外显子组测序、转录组...
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二代测序中barcodes index的介绍 Glossary

二代测序中barcodes index的介绍

刚接触高通量测序的同学,可能会接触到barcode index等名词。 为什么要有barcodes ? 原因很简单,一个lane有效数据30来G 我们并常常不可能拿一个样品测那么大数据量,尤其是RNA...
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