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Transcriptomics

用limma对芯片数据做差异分析

用基因芯片的手段来探针基因表达量的技术虽然已经在逐步被RNA-seq技术取代,但毕竟经历了十多年的发展了,在GEO或arrayexpress数据库里面存储的全球研究者数据都已经超过了50PB了!实在是...
09/1535,5801
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Transcriptomics

从spike-in到DESeq2:文库normalization

最近在处理一批RNA-seq的数据,里面混入了spike-in。利用spike-in矫正之后,样本A的基因表达量普遍比样本B的基因表达量高3-5倍,这和我所熟知的背景知识是一致的。 但是当我使用DES...
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