SRA文件格式转换 Bioinformatics

SRA文件格式转换

最近NCBI的数据格式由于空间缘故都转换成了*.sra格式,不再支持*.fastq.gz,因此需要一个特别的转化工具来转换下载的*.sra数据文件。 下载地址: http://www.ncbi.nlm...
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趋同进化,趋异进化,协同进化 Glossary

趋同进化,趋异进化,协同进化

1 . 趋同进化 “趋同”即殊途同归的意思。它是指亲缘关系较远的生物,由于生活环境、生活方式相似而在长期的适应过程中所形成的体形或器官等异常相似的 现象。它是不同生物在相同环境条件下得到相同选择的结果...
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基因数据库下载 Bioinformatics

基因数据库下载

下面是Ensembl上的基因数据库下载,主要是哺乳动物,包括基因组序列,核酸序列,蛋白序列,及这些序列在EMBL和NCBI上的注释,还有提供的MYSQL数据库文件,并对物种名称做了一下简单的翻译,方便...
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三代测序数据pacbio数据处理 Bioinformatics

三代测序数据pacbio数据处理

三代测序仪现在逐步投入正式使用之中,目前三代测序例如pacbio数据大的特点之一就是测序得到的reads特别长,最近我开展的一个项目中利用pacbio测序的到的reads中最长的到了23165bp,平...
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基因组注释介绍 Bioinformatics

基因组注释介绍

基因组注释主要包括四个研究方向:重复序列的识别;非编码RNA的预测;基因结构预测和基因功能注释。我们将分别对这四个领域进行阐述。 1:重复序列的识别。 重复序列的研究背景和意义:重复序列可分为串联重复...
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