Script

R语言基础入门之四:常用的统计推断

通常一个研究项目能够获得的数据是有限的,以有限的样本特征来推断总体特征就称为统计推断。推断又可细分为区间估计和假设检验,二者虽有区别,但却是一枚硬币的两面,之间有着紧密的关联。 一、对总体均值进行区间...
阅读全文
Script

R语言基础入门之一:引言

一、什么是R语言 R语言是一个开源的数据分析环境,起初是由数位统计学家建立起来,以更好的进行统计计算和绘图,这篇wiki中包含了一些基本情况的介绍。由于R可以通过安装扩展包(Packages)而得到增...
阅读全文
Script

R中正则表达式简介

R中的grep、grepl、sub、gsub、regexpr、gregexpr等函数都使用正则表达式的规则进行匹配。默认是egrep的规则,也可以选用Perl语言的规则。在这里,我们以R中的sub函数...
阅读全文
Script

R的内存管理和垃圾清理

写R程序的人,相信都会遇到过“cannot allocate vector of size”或者“无法分配大小为…的矢量”这样的错误。原因很简单,基本都是产生一个大矩阵等对象时发生的,最干脆的解决办法...
阅读全文
Bioinformatics

ABI测序仪

过去20年,美国应用生物系统公司(ABI)在测序方面一直占据着垄断地位。自公司的共同创始人Leroy Hood在上世纪80年代中期设计了第一台自动荧光测序仪之后,生命科学研究就摆脱了手工测序的繁琐和辛...
阅读全文
Bioinformatics

ROCH-454 测序仪介绍

454公司可谓新一代测序技术的奠基人。2005年底,454公司推出了革命性的基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统——Genome Sequencer 20 System,被《Nature》杂志以里...
阅读全文