hmmer的安装与使用 Genomics

hmmer的安装与使用

从功能基因研究的角度来讲,相关的搜索,比如从序列数据库中,找同源的序列,或者对一个对一个新的基因功能进行鉴定,使用hmmer比使用blast有着更高的灵敏度已经更高的搜索速度,但其应用还远没有blas...
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基于HMM的基因功能鉴定 Glossary

基于HMM的基因功能鉴定

  目的: 鉴定该物种中某个基因家族的所有成员; 每个基因的功能鉴定; 什么是HMM:         HMM(Hidden Markov Model,隐马尔科夫模型)是一种用参数表示的用于...
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GFF格式说明 Glossary

GFF格式说明

  gff格式是Sanger研究所定义,是一种简单的、方便的对于DNA、RNA以及蛋白质序列的特征进行描述的一种数据格式,比如序列的那里到那里是基因,已经成为序列注释的通用格式,比如基因组的...
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