此图代表我的心 [code lang="R"] n=50000; r=0.7;r_e=(1-r*r)^.5; X=rnorm(n); Y=X*r+r_e*rnorm(n); Y=ifelse(X>...
深度（depth）与覆盖度（coverage）
假想实验 对长100bp的目标区域进行捕获测序：采用单端测序，每个read长5bp；总共得到了200个reads；把所有的reads比对到目标区域后，100bp的目标区域中有98bp的位置至少有1个r...
perl的LWP模块简单介绍
一 LWP::Simple 功能 1. 如何在Perl中使用该模块？ [code lang="perl"] use LWP::Simple; [/code] 2. 如何获取一个页面内容？ [code ...
用perl提取HTML 网页内容
利用LWP::Simple模块，提取网页源代码，赋值给一个字符串变量，然后再进行后续分析，比如部分文件的提取等等： [code lang="perl"] use LWP::Simple qw(get)...
利用R画Venn（文氏图、韦恩）图
[code lang="R"] > library(VennDiagram) Loading required package: grid Warning message: package 'V...
DNA各种序列格式介绍
1.Plain格式 A sequence in plain format may contain only IUPAC characters and spaces (no numbers!). Not...
What is scaffold?
A scaffold is a portion of the genome sequence reconstructed from end-sequenced whole-genome shotgun...
Circos入门教程
安装前的一些准备 Config::General File::Basename File::Spec::Functions GD GD::Polyline Getopt::Long IO::File ...
Circos：系统生物学里一个画图工具
Circos是一款非常不错的画图工具，可以广泛用于系统生物学、生物信息学。下面是相关介绍。 Circos is a software package for visualizing data and ...
BioInfoServ：一款基于web的生物信息平台系统
BioInfoServ是一个基于Xubuntu Linux构建和开发，以生命科学研究及生物信息分析为应用目的的生物信息平台系统。BioInfoServ具有良好的生物信息运行环境及用户分析界面，包含上百...