一直以来学生们被教授蛋白质的三维形状对于它的功能是至关重要的，但原来许多的蛋白质是以“混乱”的状态存在且具有功能。 如果你打开任何一本生物学教材翻到蛋白质的部分，你将会学到蛋白质是由氨基酸序列组成，序...
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Bioinformatics
SignalP：信号肽预测工具
SignalP是一个信号肽预测服务器，它的功能是预测给定的氨基酸序列中是否存在潜在的信号肽剪切位点及其所在，原核生物和真核生物都可以进行预测。目前服务器提供的是SignalP 4.0版本。在线服务器网...
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批量鉴定蛋白的结构域的平台介绍
构建批量蛋白质结构域鉴定的分析平台，可以使用hmmscan(hmmer3)、hhsearch、InterProScan等，这里主要介绍hmmscan与hhsearch。 hmmsca...
Bioinformatics
GO分析的相关工具
GO委员会工具 AmiGO AmiGO提供检索和浏览GO委员会提供的本体学(ontology)和注释(annotation)数据。用户可以通过检索蛋白获得相应的GO术语，可以检索GO术语得到相应的细节...
Bioinformatics
蛋白注释相关的工具
随着蛋白质数量的增加，对于这些蛋白质的分类与注释成为一个非常活跃的课题。这里将包含所有蛋白质序列的集合称为nr库，在nr库中，序列与序列的相似性是不均等的，当我们使用blast进行序列两两比对的时候，...