1. OrthoMCL的用途 基于序列的相似性，OrthoMCL能将一组proteins（比如全基因组的proteins）归类到ortholog groups、in-paralogs groups和c...
OrthoMCL介绍
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直系同源与旁系同源
Homologous sequences. Orthologs and Paralogs are two types of homologous sequences. Orthology descri...
OrthoMCL使用详解
1.Orthomcl是用来干嘛的？ 我们都知道，我们在注释完一些基因组后，会拿到大量的蛋白，而这些蛋白，孤零零的放在那，你不觉得别扭吗？除了常规的pfam、interpro做完了，再做点什么呢？聚个类...
直系同源预测方法
直系同源的基因通常具有相似的生物学功能，所以我们在进行一个未知序列的功能的鉴定的时候，其实质在找功能已知的同源基因。功能基因组的研究过程中，对于两个或者多个物种的同源基因进行鉴定，是功能基因鉴定、比较...
NCBI的COG介绍
什么是COG？ “COG”是Cluster of Orthologous Groups of proteins（蛋白相邻类的聚簇）的缩写。构成每个COG的蛋白都是被假定为来自于一个祖先蛋白，并且因此或...
Inparanoid:寻找物种间直系同源基因的软件
Inparanoid是一个寻找物种间直系同源基因的软件，同时相应的网站目前包含了100 organisms， 1687023 sequences。 Inparanoid单机版程序是一款非常优秀的寻找直...