FASTX-Toolkit Bioinformatics

FASTX-Toolkit

FASTX-Toolkit是一款用于处理Short-Reads FASTA/FASTQ文件的程序,里面包含了丰富的FASTA/FASTQ文件格式转换、统计等命令。 下面是其功能介绍:  FASTQ-t...
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FastQ格式介绍 Glossary

FastQ格式介绍

为了便于测序数据的发布和共享,高通量测序数据以FASTQ 格式来记录所测的碱基读段和质量分数.如下图 所示,FASTQ 格式以测序读段为单位存储,每条读段占4 行,其中第1 行和第3行由文件识别标志和...
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fastaq2fasta Script

fastaq2fasta

之前在本博客上发表一篇利用sed 将fastq转换成fasta的文章,这种方法利用linux系统自带的程序sed进行处理,速度很快,但是后来发现当fastq中某一reads的质量值以‘@’开头的话就会...
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