进化树上Bootstrap和Identity区别 Evolution

进化树上Bootstrap和Identity区别

Bootstrap,即自展值,是用来检验你所计算的进化树分支可信度的。简单地讲就是把序列的位点都重排,重排后的序列再用相同的办法构树,如果原来树的分枝在重排后构的树中也出现了,就给这个分枝打上一分,如...
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用RAxML构建极大似然进化树 Evolution

用RAxML构建极大似然进化树

张金龙 中国科学院植物研究所,jinlongzhang01@gmail.com   RAxML 是用极大似然法建立进化树的软件之一,可以处理超大规模的序列数据,包括 上千至上万个物种,几百至...
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什么是bootstrap Glossary

什么是bootstrap

Bootstrap又称自展法,是用小样本估计总体值的一种非参数方法,在进化和生态学研究中应用十分广泛。例如进化树分化节点的自展支持率等。 Bootstrap的思想,是生成一系列bootstrap伪样本...
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