Bioinformatics

根据Barcode序列拆分fastq文件

扩增子测序不同于其他高通量测序项目,扩增子测序往往样品量较大,但单个样品的数据量要求不高(因为仅仅研究扩增区域的序列)。为了节约成本,研究者们通常会把多个样品混在一个文库,并给不同样品加上一段 Bar...
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碱基平衡性与barcode选择

碱基平衡性 碱基复杂度与碱基多样性是一个意思;复杂度高,碱基即平衡。低多样性(low diversity)即碱基不平衡,指碱基的组成太单纯了,种类少。碱基复杂度本来无关紧要,从前除了设计PCR的时候考...
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二代测序的barcode/index

二代测序二代测序是做什么的 如何选择好的barcode barcode组合举例 建库测序时barcode是如何发挥作用的 barcode,也叫index,在二代测序里面是用于区分不同样品的。为了避免概...
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二代测序的Barcode选择

1 混合样本测序 现代测序仪的生产能力正在经历突飞猛进的提高,数据量远远大于单个样本测序所需,因此在很多情况下,需要把多个样本混合在一起测序,以充分发挥仪器的能力,节约测序成本。像外显子组测序、转录组...
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