BioinformaticsOrthoMCL的使用 OrthoMCL的使用分13步进行,如下:1. 安装和配置数据库Orthomcl可以使用Oracle和Mysql数据库,而在这里只介绍使用Mysql数据库。 修改配置文件/etc/my.cnf,对My... 09月18日12,4391 OrthoMCL 直系同源基因 阅读全文
BioinformaticsOrthoMCL介绍 1. OrthoMCL的用途 基于序列的相似性,OrthoMCL能将一组proteins(比如全基因组的proteins)归类到ortholog groups、in-paralogs groups和c... 09月17日7,116评论orthologs 直系同源基因 阅读全文
Bioinformatics直系同源预测方法 直系同源的基因通常具有相似的生物学功能,所以我们在进行一个未知序列的功能的鉴定的时候,其实质在找功能已知的同源基因。功能基因组的研究过程中,对于两个或者多个物种的同源基因进行鉴定,是功能基因鉴定、比较... 02月03日10,62313orthologs 直系同源基因 阅读全文
BioinformaticsNCBI的COG介绍 什么是COG? “COG”是Cluster of Orthologous Groups of proteins(蛋白相邻类的聚簇)的缩写。构成每个COG的蛋白都是被假定为来自于一个祖先蛋白,并且因此或... 12月14日8,425评论orthologs 直系同源基因 阅读全文
GenomicsInparanoid:寻找物种间直系同源基因的软件 Inparanoid是一个寻找物种间直系同源基因的软件,同时相应的网站目前包含了100 organisms, 1687023 sequences。 Inparanoid单机版程序是一款非常优秀的寻找直... 12月11日11,83618orthologs 直系同源基因 阅读全文