OrthoMCL的使用分13步进行，如下：1. 安装和配置数据库Orthomcl可以使用Oracle和Mysql数据库，而在这里只介绍使用Mysql数据库。 修改配置文件/etc/my.cnf，对My...
OrthoMCL的使用
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OrthoMCL介绍
1. OrthoMCL的用途 基于序列的相似性，OrthoMCL能将一组proteins（比如全基因组的proteins）归类到ortholog groups、in-paralogs groups和c...
直系同源预测方法
直系同源的基因通常具有相似的生物学功能，所以我们在进行一个未知序列的功能的鉴定的时候，其实质在找功能已知的同源基因。功能基因组的研究过程中，对于两个或者多个物种的同源基因进行鉴定，是功能基因鉴定、比较...
NCBI的COG介绍
什么是COG？ “COG”是Cluster of Orthologous Groups of proteins（蛋白相邻类的聚簇）的缩写。构成每个COG的蛋白都是被假定为来自于一个祖先蛋白，并且因此或...
Inparanoid:寻找物种间直系同源基因的软件
Inparanoid是一个寻找物种间直系同源基因的软件，同时相应的网站目前包含了100 organisms， 1687023 sequences。 Inparanoid单机版程序是一款非常优秀的寻找直...