RNA-Seq分析新工具 Transcriptomics

RNA-Seq分析新工具

利用RNA-Seq技术来分析转录组现在是一种很普遍的方法,在我读PhD期间分析过细菌的转录组数据。做差异表达分析的基本流程是:做质量控制->利用bwa map reads到基因组上->计算...
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KMeans中自动K值的确认方法 Machine Learning

KMeans中自动K值的确认方法

1  前言 聚类常用于数据探索或挖掘前期,在没有做先验经验的背景下做的探索性分析,也适用于样本量较大情况下的数据预处理等方面工作。例如针对企业整体用户特征,在未得到相关知识或经验之前先根据数据本身特点...
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聚类分析:k-means和层次聚类 Machine Learning

聚类分析:k-means和层次聚类

尽管我个人非常不喜欢人们被划分圈子,因为这样就有了歧视、偏见、排挤和矛盾,但“物以类聚,人以群分”确实是一种客观的现实——这其中就蕴含着聚类分析的思想。 前面所提到的机器学习算法主要都是分类和回归,这...
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使用K-means进行颜色量化 Bioinformatics

使用K-means进行颜色量化

在这篇文章中,我想谈谈颜色量化以及如何使用k-means聚类算法来执行它,以及优化其方法。 这里提供的代码是用python编写的,来自这个项目。 什么是颜色量化? 颜色量化是指一个减少在图像中的颜色数...
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