两列样本数据的差异基因筛选方法：FoldChange法+FDR控制 其中，FDR值的计算方法如下： 1）对每个基因进行p-value的计算 假设观测到基因A对应的reads数为x，已知在一个大文库中，...

BLAST+与BLAST比较 BLAST已经成为序列比对软件代名词，且其词性也已经开始变化，诸如BLASTing之类的词汇在各种论文中已是屡见不鲜，可见其影响之深，使用之广，如同分子生物学领域中的PC...

为了让更多的实验室能够有机会使用新一代测序技术，各大公司也争相推出了个人型测序仪。生物通近期对市场上三款热门的个人型测序仪进行了介绍，包括罗氏454的GS Junior、Life Technologi...

今天搜了一下，在PLoB中已经有不少介绍构建进化树的文章，目前构建进化树的算法中比较常用的有ML（maximum likelihood，最大似然），MP（maximum parsimony，最大简约）...

汤海明1,  陈红1,  张静1,  任景怡1,  许宁2 1.  北京大学人民医院心内科,  北京  100044; 2.  瑞典卡罗林斯卡医学院医学系,  斯德哥尔摩  17176 摘要: Mic...

作者：王先荣 本文翻译自维基百科，英文原文地址是：http://en.wikipedia.org/wiki/ransac，如果您英语不错，建议您直接查看原文。 RANSAC是“RANdom SAmpl...

前段时间在Briefings in Bioinformatics上发表一篇关于超快速序列聚类分析的文章，文章原始是想列举目前可以用于meta-genome序列分析的算法，但是这列算法和工具也可以用于其...

刘万飞 王西亮 赵宇慧 曾瀞瑶 耿佳宁 胡松年  中国科学院北京基因组研究所 摘要: 随着基于第二代测序技术的细菌基因组与转录组研究越来越广泛,选择合适的研究策略变得越来越重要。就基于第二代测序技术的...

一、蛋白质的结构与功能预测 蛋白质结构与功能的研究已有相当长的历史，由于其复杂性，对其结构与功能的预测不论是方法论还是基础理论方面均较复杂。统计学方法曾被成功地应用于蛋白质二级结构预测中，如Chou和...

多序列比对简介： 双序列比对是序列分析的基础。然而，对于构成基因家族的成组的序列来说，我们要建立多个序列之间的关系，这样才能揭示整个基因家族的特征。多序列比对在阐明一组相关序列的重要生物学模式方面起着...