芯片数据分析介绍 Bioinformatics

芯片数据分析介绍

芯片分析概述 随着基因芯片技术的普及,基因表达数据大量产生,如何充分利用这些数据并从中提取有用的生物学知识,是生物信息学所面临的一个迫切问题。简要来说,生物芯片数据分析流程大体可分成以下几个阶段。 扫...
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各种高通量测序仪比较 Advance

各种高通量测序仪比较

高通量测序技术发展的真是快啊,454最近发布的GS FLX Titanium XL+系统的测序长度已经可达700~1000bp了!!通量700M,运行时间23小时。资料请看这里。虽然454的通量有点低...
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BLAST+的使用 Bioinformatics

BLAST+的使用

BLAST+与BLAST相比,有很多改进和提高,NCBI强烈推荐放弃BLAST,使用BLAST+, 这里说的BLAST和BLAST+,都是本地的。BLAST下载地址:NCBI BLAST+ (ftp:...
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用R读取Excel Script

用R读取Excel

还在纠结用如何用R读取Excel的同学有福了。昨天逛CRAN的时候发现了一个xlsx包,它给出的介绍是可以读取、写入Excel 2007/2003文件并支持格式的设置。简单地来说,将Excel读取为数...
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MCMC中的Metropolis Hastings抽样法 Script

MCMC中的Metropolis Hastings抽样法

Metropolis Hasting(下面简称MH)是蒙特卡罗马尔科夫链中一种重要的抽样方法。本文简要介绍MH算法,并给出一个实例。 MH算法在参数空间随机取值,作为起始点。按照参数的概率分布生成随机...
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