构建进化树可以用DNA序列，也可以用protein序列。本文就如何利用蛋白序列进行进化树的构建步骤进行详细解析： 一、利用phylip进行蛋白序列进化树分析步骤 1. 运行Clustalw，得到pro...

在现代分子进化研究中，根据现有生物基因或物种多样性来重建生物的进化史是一个非常重要的问题。一个可靠的系统发生的推断，将揭示出有关生物进化过程的顺序，有助于我们了解生物进化的历史和进化机制。 对于一个完...

生物信息学教程系列 第五章 5 分子进化 分子进化钟的发现与中性理论的提出，极大地推动了进化尤其是分子进化研究，填补了人们对分子进化即微观进化认识上的空白，推动进化论的研究进入分子水平，并建立了一套依...

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有时,在推断进化树的过程中,我们希望phylip格式的文件能够将序列的名称完整得保留下来。通常情况下,我们的名称会超过10字符, 而ClustalX和MUSCLE等软件给出的phylip文件是严格的p...

之前介绍了用RAxML构建极大似然进化树的方法。本文另外介绍一款很经典的构建进化树的软件--- Phylip。 以下是官方介绍： PHYLIP is a free package of program...