SRA文件格式转换 Bioinformatics

SRA文件格式转换

最近NCBI的数据格式由于空间缘故都转换成了*.sra格式,不再支持*.fastq.gz,因此需要一个特别的转化工具来转换下载的*.sra数据文件。 下载地址: http://www.ncbi.nlm...
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三代测序数据pacbio数据处理 Bioinformatics

三代测序数据pacbio数据处理

三代测序仪现在逐步投入正式使用之中,目前三代测序例如pacbio数据大的特点之一就是测序得到的reads特别长,最近我开展的一个项目中利用pacbio测序的到的reads中最长的到了23165bp,平...
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RNAseq测序reads定位 Transcriptomics

RNAseq测序reads定位

获得RNA-seq的原始数据后,首先需要将所有测序读段通过序列映射(mapping)定位到参考基因组上,这是所有后续处理和分析的基础.在读段定位之前,有时还需要根据测序数据情况对其做某些基本的预处理....
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