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Bioperl快速检索序列(Bioperl HOWTO翻译11)

索引序列文件以用于快速检索 英文原文 索引序列是Bioperl一个非常出色的功能。你可以将需要处理的本地序列文件建立一个索引然后利用这个索引提取你所需要的序列文件。这样做最重要的原因是——速度!从有索...
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详解Bioperl的序列对象(Bioperl HOWTO翻译7)

序列对象 英文原文 前面涉及到了很多序列对象,展示了序列对象的一些创建和使用方法。这里来详细描述序列对象的功能。 下表列出了序列对象的‘方法’(面向对象编程中的概念,见前文;表的内容就不翻译了)。‘r...
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利用bioperl读取复杂序列

Genbank序列描述的内容就非常丰富(类似的还有SwissProt,EMBL等格式的序列),除了名称、描述和序列字符串以外还有序列号、形状(线状还是环状?)、发布日期、所属物种以及序列内包含的基因、...
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