Bioinformatics

看懂Circos图

首先我们通过下图从整体上了解下Circos的工作流程,其中核心的是config配置文件,它决定了Circos的每一圈读入什么样的数据,并且决定它们以什么方式展示,是柱状图还是散点图,也包括颜色、字体等...
阅读全文
Bioinformatics

主成分分析(PCA)原理详解

一、PCA简介 1. 相关背景 上完陈恩红老师的《机器学习与知识发现》和季海波老师的《矩阵代数》两门课之后,颇有体会。最近在做主成分分析和奇异值分解方面的项目,所以记录一下心得体会。 在许多领域的研究...
阅读全文
Single Cell

单细胞轨迹分析dyno使用教程

在上一期的《单细胞轨迹分析知多少--拟时间分析比较》中我们介绍了45种单细胞轨迹推断分析软件方法在以下4个方面的比较: 准确性 可扩展性 稳定性 可用性 得出了几项重要结论: 轨迹推断(TI,traj...
阅读全文
Statistics

应用SPSS进行重复测量数据分析

重复测量设计,即对一组或多组受试对象,在k个(k≥2)不同的时间点上,从每个人体(或样本)上重复观测同一个指标的具体取值的设计。如临床研究中,需要观察患者在不同时间的某些生理、生化或病理指标的变化趋势...
阅读全文