软件链接地址：https://code.google.com/p/edmr/ 该软件是可以基于对methylkit 软件包进行 进一步处理的，在处理和找寻差异甲基化为点和区域，分析的要比 methyl...
Trinity学习笔记
1:分析流程图如下 2: 首先就是将样本的reads合并在一起命令如下： cat 1M_READS_sample/*.left.fq > reads.ALL.left.fq cat 1M_REA...
Tophat+cufflinks 学习笔记
整个分析用TopHat进行比对，比对完成后将比对输出作为cufflinke拼接的输入（单独拼接），将单独拼接的结果使用cuffmerge混合，然后使用cuffdiff做差异，使用r软件包CummeRb...