多组学实验设计及数据分析系列培训(第二期)

  • 简介

上海市生物信息学会(Shanghai Society for Bioinformatics,缩写SSBI)成立于2005年6月,是上海市科学技术协会下属的地方性学术团体,依托单位为上海生物信息技术研究中心。

上海生物信息技术研究中心在系统建模、定量组学数据获取、分析、数据整合及其相互作用网络分析技术平台建设方面取得了一系列国内外瞩目的研究成果。在此基础上,近年来又建立了新一代测序技术平台,以及依托Thermo Q Exactive、AB QTRAP 4000等仪器的质谱技术平台,能够开展基因组、甲基化组、转录组、蛋白质组、代谢组等不同层次的一站式高通量检测及数据分析。

上海市药物转化工程技术研究中心成立于2014年,致力于发展高效、低毒、个性化肿瘤治疗方案和药物研发技术体系,推动转化医学的发展。

 

主办单位: 

上海市生物信息学会

协办单位:

上海药物转化工程技术研究中心

上海生物信息技术研究中心

苏州贝斯派生物科技有限公司

上海麦其知识产权代理事务所

会议地点:

上海浦东新区科苑路1300号浦东国际人才城2楼智音厅(曙光医院对面)

开班时间:

11月12日(周四)-11月14日(周六)

  • 课程信息
日期 课程名称 课程内容 时间
 

 

 

11月12日

(星期四)

报道-开班仪式 生物信息中心介绍 8:30-9:00
蛋白质组学实验设计及数据分析 蛋白质组学—样本处理和实验方法

蛋白质组学的方法和进展

蛋白质组学—搜库及差异蛋白筛选

(Maxquant上机操作)

9:00-12:00
代谢组学实验设计及数据分析 代谢组学实验设计及样本处理

代谢组学数据处理-多维统计分析(SIMCA-P上机操作)

13:30-17:00
 

 

 

11月13日

(星期五)

转录组数据分析 有referecnce转录组数据分析

无reference转录组数据分析

转录组高级数据分析(聚类、网络构建等)

9:00-12:00
蛋白质结构与功能分析 蛋白质结构预测与变异分析

分子对接与虚拟筛选

13:30-15:00
多组学数据整合分析 多组学数据整合分析案例 15:45-16:30
参观、合影 参观上海生物信息技术研究中心 16:30-17:00
 

 

11月14日

(星期六)

组学分析常用软件上机练习 GO和KEGG注释分析,热图绘制与聚类分析、ROC分析等常用方法Cytoscape、Mev、

HemI、STRING、DAVID、KOBAS等软件使用

9:00-12:00
科研工作中的专利挖掘和专利保护 13:30-16:00

注:1.课程具体安排以报名当天的课程表为准;

2.因需上机练习,请自带笔记本电脑,默认是windows系统,若安装的是linux或苹果iOS请自行下载上机软件。

 

  • 讲师介绍
  1. 吴谦博士,副研究员,上海生物信息技术研究中心质谱实验室负责人。本科、硕士毕业于复旦大学化学系,博士毕业于上海交通大学药学院。从事质谱研究与开发十余年,曾在某知名上市药企从事新药研发工作,参与十余个一类新药项目及部分重组蛋白药物研发。主要研究方向为蛋白质组学、代谢组学及质谱定量分析新方法开发,发表论文10余篇,在基于LC-MS技术的代谢组学特别是脂质组学检测实验与分析方面具有丰富经验。
  2. 库鑫博士,上海交通大学系统生物医学研究院讲师。本科毕业于华中科技大学同济医学院,硕士毕业于中科院上海药物研究所,博士毕业于德国慕尼黑工业大学(Technische Universität München)生物分析与蛋白质组学研究所( Bernhard Kuster)。长期从事肿瘤蛋白质组学的相关研究,在国际期刊上发表过多篇相关论文。目前研究方向为肿瘤相关生物标志物的发现和蛋白质糖基化修饰。
  3. 李君一博士,中国科学院上海生命科学研究院系统生物学国家重点实验室博士后。本科毕业于北京大学物理学院,硕士毕业于美国新泽西州立罗格斯大学统计学系,博士毕业于罗格斯大学生物物理专业。随后在罗格斯大学进行生物信息学博士后研究。2013年起在中国科学院上海生命科学研究院系统生物学国家重点实验室继续生物信息学博士后工作。研究方向为运用统计算法及数理模型,从高通量数据出发,解决遗传学和表观遗传学问题。近几年专注于复杂疾病(如癌症、糖尿病等)相关的高通量转录组数据分析。
  4. 戴文韬博士,上海生物信息技术研究中心转化医学平台生物信息负责人。本科毕业于华东师范大学生命科学院,博士毕业于中科院生物物理所。从事生物信息学研究多年,利用数据挖掘和机器学习方法从事生物大分子模拟分析,组学数据分析挖掘等工作。发展了进行蛋白结构模型质量评估和蛋白相互作用界面预测的算法,开发了在国内处于最高精度的蛋白结构预测服务器。
  5. 董红曼律师,专利代理人,上海麦其知识产权代理事务所的创始合伙人。本科、硕士毕业于华东师范大学生物化学专业,同时获上海交通大学法律硕士。国际保护知识产权协会、国际商标协会、全国专利代理人协会、技术经纪协会会员。执业领域以知识产权法律为主,为海内外企业提供中国及外国的专利商标事务,包括申请、复审、无效、异议、维权诉讼,以及商业并购中的技术转让许可等法律事务。
  6. 李园园博士,研究员,上海生物信息技术研究中心系统生物学课题组长,上海生物医学研究院生物医学转化应用中心副主任,上海药物转化工程技术研究中心执行主任,上海生物信息学会理事。本科毕业于南开大学,硕士毕业于协和医科大学肿瘤研究所,博士毕业于中科院上海生化细胞所。研究方向为生物信息学,系统生物学,转化医学。在PLoS Computational Biology、Bioinformatics、Molecular Systems Biology等国际权威专业期刊上发表论文50余篇,其中第一或通讯作者30余篇。获软件著作权7项,发明专利授权3项。担任国家自然科学基金评审专家,任PLoS Computational Biology、PLoS ONE、BMC Systems Biology、BMC Bioinformatics、BMC Genomics、Gene、中国科学等10余家专业期刊审稿人。作为项目负责人承担多项国家自然科学基金面上项目、973项目、863项目、上海市科委重大项目等。2006年上海市科技启明星。2013年明治生命科学奖。
  • 费用:

会议费用:3500元/人

在校学生持学生证: 3000元/人

(优惠:同一个单位,3人以上集体报名(含3名),3000元/人。10月31日之前打款,3000元/人。)

说明:以上费用含证书(上海生物信息学会颁发)、材料、税金、午餐、茶点

 

付款方式:

单位:苏州贝斯派生物科技有限公司

开户行:中国银行股份有限公司苏州斜塘支行

账号:539158194515

联系方式:

联系人:李正涛

电话:021-20283626

Email:ztli@basepair.cn

手机:18918298221

如您计划参加,可以登录上海生物信息技术研究中心网站(http://www.scbit.org)查看详细内容或登录科学网、丁香园等网址查询或联系当地培训负责人。

  • 文章来源: 未知。文章来源待更新,请等待。
  • 版权说明: 除非特殊说明,本站文章版权归于文章来源网站或投稿作者。未标记来源文章,请原作者联系管理员更新版权信息

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目前评论:1   其中:访客  1   博主  0

  1. yiluyingxiao 0

    提前祝您新年快乐。
    乙未年(羊)冬月十九 2015-12-29