Transcriptomics差异表达分析之FDR 本文来自百迈客基因微信公众号(BMK_product) 随着测序成本的不断降低,转录组测序分析已逐渐成为一种很常用的分析手段。但对于转录组分析当中的一些概念,很多人还不是很清楚。今天,小编就来谈谈在转... 07月26日20,057评论FDR 差异表达 阅读全文
StatisticsSPSS卡方检验p小于0.05之后的Bonferroni校正和Holm–Bonferroni校正 小明:我想比较三组之间的疗效有无差异 小编:卡方检验或者单因素logistic回归啊 小明:get it,结果显示p 03月15日863评论FDR校正 卡方检验 阅读全文
Statistics浅谈多重检验校正FDR 例如,在我们对鉴定到的差异蛋白做GO功能注释后,通常会计算一个p值。当某个蛋白的p值小于0.05(5%)时,我们通常认为这个蛋白在两个样本中的表达是有差异的。但是仍旧有5%的概率,这个蛋白并不是差异蛋... 11月17日3,679评论FDR FDR校正 阅读全文
Bioinformatics多重假设检验中的p值校正 在生物学特别是基因组学的研究工作中,经常会遇到多重假设检验(multiple testing)的问题;此时,得到的原始p值需要进行校正后才能使用,那么哪种校正方法更加适合自己的研究工作呢?p-valu... 09月03日13,5572FDR 统计 阅读全文
Transcriptomics差异基因分析方法 在利用RNA-seq数据比较分析两个样品中同一个基因是否存在差异表达的时候,一般选取两个标准: i)FoldChange FoldChange,很容易理解了。就是两样品中同一个基因表达水平的变化倍数。... 06月27日15,2962FDR 差异表达 阅读全文
Script多重检验中的FDR错误控制方法与p-value的校正 数据分析中常碰见多重检验问题(multiple testing).Benjamini于1995年提出一种方法,通过控制FDR(False Discovery Rate)来决定P值的域值. 假设你挑选了... 06月04日7,655评论p-value R 阅读全文