Genomics

目标序列捕获测序常见问题集锦

目标序列捕获测序,是将感兴趣的基因组区域定制成特异性探针与基因组DNA进行杂交(固相或液相),将目标基因组区域的DNA片段进行富集后再利用第二代测序技术进行测序。这种新的方法与PCR方法相比,通量高,...
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Genomics

各种测序文库构建方式

目前3种测序技术 Roche 454,Solexa和ABI SOLID均有单端测序和双端测序两种方式。在基因组De Novo测序过程中,Roche 454的单端测序读长可以达到400 bp,经常用于基...
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Glossary

物理图谱

【相关概念】 DNA限制性内切酶酶切图谱又称DNA的物理图谱,它由一系列位置确定的多种限制性内切酶酶切位点组成,以直线或环状图式表示。在DNA序列分析、基因组的功能图谱绘制、DNA的无性繁殖、基因文库...
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Genomics

影响3730测序质量的因素

  (1)  DNA模板问题(关键因素) (a) 非特异PCR产物     现象:每个峰下面都有其他颜色。 原因:PCR主带与杂带混在一起测序。 对策:凝胶电泳回收主带,重新测序。 (b) 非单克隆 ...
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Bioinformatics

测序峰图的基本知识

  测序公司发送的测序结果一般有一个峰图文件和一个序列文件,峰图文件为Abi格式,用chromas软件(网上可下载)打开. 四种颜色的波形代表四种碱基的信号强度; 正常的峰图,波峰与波谷清晰...
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