各种高通量测序仪比较 Advance

各种高通量测序仪比较

高通量测序技术发展的真是快啊,454最近发布的GS FLX Titanium XL+系统的测序长度已经可达700~1000bp了!!通量700M,运行时间23小时。资料请看这里。虽然454的通量有点低...
阅读全文
常用的SNP检测方法 Genomics

常用的SNP检测方法

SNP 是指基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA 序列多态性,在群体中的发生频率不小于1 %。包括单个碱基的转换、颠换、插入和缺失等。所谓转换是指同型碱基之间的转换,如嘌呤与嘌呤( G2A) ...
阅读全文
Quake的安装方法 Genomics

Quake的安装方法

目前用于二代测序Reads中错误校正的工具比较多,如SOAP的correction、Quake等,目前quake效果比较不错。下面给大家简单介绍quake软件的安装方法 安装 Quake在使用中需要一...
阅读全文
转录组测序问题集锦 Transcriptomics

转录组测序问题集锦

转录组是某个物种或者特定细胞类型产生的所有转录本的集合,转录组测序(RNA-seq) 是最近发展起来的利用深度测序技术进行转录分析的方法,可以对全转录组进行系统的研究。 Roche GS FLX Ti...
阅读全文
DNA甲基化测序问题集锦 Genomics

DNA甲基化测序问题集锦

DNA甲基化(DNA methylation)为DNA化学修饰的一种形式,能在不改变DNA序列的前提下,改变遗传表观。 DNA甲基化在维持细胞正常功能、传递基因组印记,胚胎发育、肿瘤发生等方面发挥重要...
阅读全文
目标序列捕获测序常见问题集锦 Genomics

目标序列捕获测序常见问题集锦

目标序列捕获测序,是将感兴趣的基因组区域定制成特异性探针与基因组DNA进行杂交(固相或液相),将目标基因组区域的DNA片段进行富集后再利用第二代测序技术进行测序。这种新的方法与PCR方法相比,通量高,...
阅读全文