现在的确又不少研究单位和公司开办关于生物信息学、二代测序数据分析等等之类的培训班，说实在这个培训班的效果有多大，确实不好说。但我个人认为，多数这类培训班都是针对生物信息刚入门的学员。因为现在高通量测序...

刘万飞 王西亮 赵宇慧 曾瀞瑶 耿佳宁 胡松年  中国科学院北京基因组研究所 摘要: 随着基于第二代测序技术的细菌基因组与转录组研究越来越广泛,选择合适的研究策略变得越来越重要。就基于第二代测序技术的...

生物信息学教程系列 第六章 6 基因组序列信息分析 DNA序列自身编码特征的分析是基因组信息学研究的基础，特别是随着大规模测序的日益增加，它的每一个环节都与信息分析紧密相关。从测序仪的光密度采样与分析...

我们都知道，测序本身并不难，难就难在基因组的后续组装拼接，因为它涉及到大量需要考虑的问题，如重复、到位、覆盖率等等，于是如何有效的得到最后的序列或者有意义的Scaffold是做基因组面临的一个很大问题...

唐碧霞 王彦青 陈旭 庞博 赵文明 (中国科学院北京基因组研究所，北京，100029) 摘 要 高通量测序技术的发展使得测序数据量大规模的增长，从而为研究人员的数据分析工作带来了 挑战。基因组可视化工...

获得软件： Phrap/cross_match/swat: Phil Green, phg@u.washington.edu Phred: Brent Ewing, bge@u.washington....

撰文╱阿克曼（Jennifer Ackerman）翻譯╱涂可欣 重点提要 人体内的细菌细胞数是人类细胞的10倍，然而研究人员直到最近，才开始了解微生物对健康的帮助。 有些细菌会制造人体无法合成的有益化...

PacBio®长读序为基因组完成带来了新变革。资深基因组装配专家开发的错误校正软件使科学家能在其短读取数据中添加长读序数据，最终将那些未完成的基因组补全。 在过去的十年，基因组装配让一些科学家渴望转向...

We would like to complete our description of SOAPdenovo2 commands and get into more interesting topi...

SOAPdenovo2 runs through the following steps - (i) generate the de Bruijn graph and store it (‘pregr...