Genomics本地安装UCSC基因组浏览器 CSC基因组浏览器在大规模高通量数据的可视化和比较分析研究中发挥着重要的作用。拥有了本地浏览器,就可以对自己的测序数据进行更深入的分析和共享使用。本文详细介绍了如何一步步在本地安装、配置、高级使用UC... 11月03日3,776评论UCSC 基因组浏览器 阅读全文
BioinformaticsIGV基因组浏览器可视化高通量测序数据 IGV是本地浏览测序数据功能最为强大的基因组浏览器,支持多种不同类型的输入格式和不同的显示方式,如峰图、线图、柱状图、Sashimi-plot。同时还可以配合bedtools使用。 新版的Window... 03月01日7,062评论IGV 基因组浏览器 阅读全文
Genomics基因组浏览器-可视化软件Integrative Genomic Viewer(IGV) 你会用到的网站: IGV 官网http://software.broadinstitute.org/software/igv/download~ Broadinstitute出品 Java versi... 03月18日2,803评论可视化 基因组浏览器 阅读全文
BioinformaticsGBrowse访问数据制备 什么样的数据,数据制备为什么格式,保存为什么样的形式,GBrowse进行怎样的设置,基因组图谱上就可以展示出来了。 要展示什么样的数据? 基因组注释数据,比如contig的拼接关系、功能基因的注释、基... 08月09日2,793评论genome perl 阅读全文
BioinformaticsGBrowse安装记录 安装步骤 perl、mysql安装略过 apache安装 [shell] % cd httpd-2.x.xx % ./configure --prefix=$HOME/httpd/prefork --... 08月09日3,0321 genome perl 阅读全文
BioinformaticsGBrowse的介绍与安装 什么是GBrowse? The Generic Genome Browser (GBrowse) is a genome viewer. GBrowse是个开源的基因组浏览器; 是一个图形化展示基因组... 08月09日4,194评论genome perl 阅读全文
BioinformaticsUCSC:基因组相关研究的一个有力工具 UCSC Genome Browser是由University of California Santa Cruz (UCSC) 创立和维护的,该站点包含有人类、小鼠和大鼠等多个物种的基因组草图,并提供... 01月08日10,232评论SNP 基因组 阅读全文