Genomics基因组组装软件velvet以及参数优化 利用k-mer组装的基因组的软件现在已经很多了,例如soapdenovo,velvet等等。PLoB上已经有不少关于velvet的软件的介绍,今天再次谈谈velvet这个软件,主要是推荐一些velve... 11月21日8,060评论k-mer velvet 阅读全文
BioinformaticsBLAST的参数与使用方法详细介绍 写这篇文章之前,我发现其实PLoB上已经有不少文章介绍blast的使用了,读者可以点击这里查看所有blast相关的文章。今天在网上看到一篇关于BLAST使用的介绍。我认为这是目前为止介绍BLAST参数... 11月20日8,116评论BLAST 参数 阅读全文
BioinformaticsBowtie2使用方法与参数详细介绍 懒人必看 Bowtie2 -q --phred33 --sensitive --end-to-end -I 0 -X 500 --fr --un unpaired --al aligned \ --u... 09月02日52,3121 参数 比对 阅读全文
Scriptmatlab的legend用法 用Matlab画图时,有时候需要对各种图标进行标注,例如,用“+”代表A的运动情况,“*”代表B的运动情况。 legend函数的基本用法是 LEGEND(string1,string2,string3... 08月31日4,145评论参数 画图 阅读全文
GenomicsRunning newbler: more de novo assembly parameters There is a long list of options/flags/parameters for a newbler assembly, some of which have been tre... 03月31日2,100评论454 拼接 阅读全文
BioinformaticsRunning newbler: de novo assembly This post is about how to start up newbler for de novo assembly projects. I will describe setting up... 03月31日2,958评论454 拼接 阅读全文