写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen）暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.TAD 2.TAD分析流程 2.1 Cworld-dekker软件的安装 git clone https:...
三维基因组技术（五）：TAD 分析流程
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三维基因组技术（四）：Compartment 分析流程
写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen）暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.Compartment计算 2.Compartment 分析流程 2.1 Cworld-dekker软件的...
三维基因组技术（三）：Hi-C 数据比对及HiC-Pro的使用
1.Hi-C原理简介 1.1 Hi-C技术高通量染色体构象捕获技术(High-throughput chromosome conformation capture)研究全基因组三维构象及分析染色质片段...
三维基因组技术（二）：Hi-C辅助组装与Lachesis的使用
写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen）暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.Hi-C 辅助组装（PGA）技术原理 染色质在细胞核内分布的并不是随机分布的，而是不同染色体占据不同的空间...
三维基因组技术（一）：简单介绍
写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen）暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.基因组空间三维结构与功能 染色质空间三维结构 染色体结构 DNA以一长串复杂的线圈形式堆积成染色体。DNA...
Hi-C文库数据质控及解读
数据自身的质量在很大程度上决定了分析结果的准确和可靠，随着Hi-C技术在三维基因组学上的快速推广，对于Hi-C数据本身的质量和测序深度也逐渐引起研究人员的重视。同时对该技术的进一步优化和改进使之能够在...