WES(1)测序质量控制 Genomics

WES(1)测序质量控制

这一步主要看看这些外显子测序数据的测序质量如何: 首先用fastqc处理,会出一些图表,肯定是没问题的啦,如果数据有问题,公司就不会给你,那样不砸了他们自己的招牌嘛。 然后我们粗略统计下平均测序深度及...
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color space的测序数据 Bioinformatics

color space的测序数据

看了illumina的测序仪市场份额的确很夸张,像我这样在生信数据分析领域身经百战的老鸟,都是直到今天才碰到color space的测序数据。测序平台是AB 5500xl Genetic Analyz...
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在centOS 5上安装HTSeq Bioinformatics

在centOS 5上安装HTSeq

安装HTSeq,需要Python版本在2.5以上(但是在Python 3下不行),并且需要安装NumPy。如果已经安装了NumPy的话,安装HTSeq并不困难。但是如果没有安装的话,可能会比较麻烦。 ...
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