用snpEFF对vcf格式的突变数据进行注释 Genomics

用snpEFF对vcf格式的突变数据进行注释

这个软件比较重要,尤其是对做遗传变异相关研究的,很多人做完了snp-calling后喜欢用ANNOVAR来进行注释,但是那个注释还是相对比较简单,只能得到该突变位点在基因的哪个区域,那个基因这样的信息...
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用samr包对芯片数据做差异分析 Transcriptomics

用samr包对芯片数据做差异分析

本来搞差异分析的工具和包就一大堆了,而且limma那个包已经非常完善了,我是不准备再讲这个的,正好有个同学问了一下这个包,我就随手测试了一下,顺便看看它跟limma有什么差异没有!手痒了就记录了测试流...
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单细胞测序综述 Advance

单细胞测序综述

1、单细胞测序概论 过去二十几年里,随着基因测序技术水平的提高以及千人基因组计划、癌症基因组计划、Meta-Hit计划等重大国际合作项目的相继开展,基因组研究日渐被推向高潮。然而,迄今为止使用的测序材...
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