蛋白质的结构与功能预测 Bioinformatics

蛋白质的结构与功能预测

一、蛋白质的结构与功能预测 蛋白质结构与功能的研究已有相当长的历史,由于其复杂性,对其结构与功能的预测不论是方法论还是基础理论方面均较复杂。统计学方法曾被成功地应用于蛋白质二级结构预测中,如Chou和...
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多序列比对 Bioinformatics

多序列比对

多序列比对简介: 双序列比对是序列分析的基础。然而,对于构成基因家族的成组的序列来说,我们要建立多个序列之间的关系,这样才能揭示整个基因家族的特征。多序列比对在阐明一组相关序列的重要生物学模式方面起着...
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Gene Ontology(GO)简介与使用介绍 Bioinformatics

Gene Ontology(GO)简介与使用介绍

1.GO怎么就出现了? 现今的生物学家们浪费了太多的时间和精力在搜寻生物信息上。这种情况归结为生物学上定义混乱的原因:不光是精确的计算机难以搜寻到这些随时间和人为多重因 素而随机改变的定义,即使是完全...
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qplot绘图函数快速入门 Script

qplot绘图函数快速入门

绘图是进行数据探索分析的重要方法,也是数据报告中的必备元素。但进行多元数据绘图时,R语言中的基本绘图工具往往很不给力,使用lattice包又要记一大堆命令。在你痛苦不堪的时候,需要ggplot2包来拯...
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R语言中的色彩 Script

R语言中的色彩

统计学家经常唠叨这样一句话,“一张好的图片胜过千言万语。”绘图正是R语言的强项。其中的基本绘图命令就包括了大量的参数配置,完全可以满足各种出版物的需要,更何况还有lattice和ggplot2这两大格...
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广义线性模型(GLM) Script

广义线性模型(GLM)

广义线性模型(generalized linear model, GLM)是简单最小二乘回归(OLS)的扩展,在OLS的假设中,响应变量是连续数值数据且服从正态分布,而且响应变量期望值与预测变量之间的...
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利用R语言进行方差分析 Script

利用R语言进行方差分析

一、单因子方差分析(one-way ANOVA) 1)建模: 我们采用multcomp包中的cholesterol数据集作为例子,其中response为响应变量,trt为预测变量,这个处理中有五种水平...
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用nls函数进行非线性回归 Script

用nls函数进行非线性回归

在许多实际问题中,回归模型中响应变量和预测变量之间的关系可能是复杂的非线性函数。有时候能通过变量变换的方法可以将其变为线性模型,有时则不能。在后一种情况下,就需要采取专门的非线性回归方法来建立模型。 ...
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