BioJava中如何使用非标准的密码子表 Script

BioJava中如何使用非标准的密码子表

在一般的翻译例子中我们使用RNATools中的方法translate()就能够很容易的进行翻译。这对于使用一般的通用翻译表来说非常合适。但有的时候,你可能使用一些诸如叶绿体翻译表等偏僻的翻译表。幸运的...
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利用BioJava翻译DNA序列或标志链 Script

利用BioJava翻译DNA序列或标志链

要将DNA翻译成蛋白必须执行下列步骤: 转录成RNA 获得标志链的密码子(三联子) 翻译成蛋白 大部分可以通过使用Biojava的Tools类的静态方法实现。下面的程序展示了这个过程。当然了,如果你的...
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使用BioEdit生成和绘制蛋白质进化树 Evolution

使用BioEdit生成和绘制蛋白质进化树

BioEdit是一个功能很强大的生物学软件,整合了很多常用的生物信息工具。如:多序列比对,质粒图谱的绘制,查看DNA序列的酶切位点等等。 使用BioEdit可以方便的生成和绘制进化树。 首先,打开序列...
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